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教授

 

  基本信息
  • 姓      名：张焱
  • 职      称：特聘教授
  • 职      位：
  • 所  属 系：生物科学系
  • 办公地点：丽湖校区守慧楼306
  • 办公电话：0755-26922024
  • 邮      箱：zhangyan@szu.edu.cn
  • 工作职责：教学、科研
  个人简介

张焱，男，1974年5月生，博士生导师，深圳大学生命与海洋科学学院特聘教授，深圳大学脑病与大数据研究所所长，深圳大学神经系统疾病临床医学研究中心副主任。1997年毕业于浙江大学医学院临床医学系，获学士学位; 2002年于中国医学科学院&北京协和医学院基础所生物医学工程系获博士学位。2002年至2009年在美国内布拉斯加大学林肯分校任博士后和高级研究助理。2009年至2011年在美国哈佛医学院&布莱根妇女医院医学系担任讲师和副遗传学家。2011年至2016年任中科院上海生命科学研究院研究员，2012年入选中科院“百人计划”。2015年获深圳市“鹏城学者”特聘教授。2017年入职深圳大学生命与海洋科学学院。先后主持国家自然科学基金、中科院、省市级科研项目和横向项目10多项。已在国外学术刊物上发表论文近90篇，包括在Chemical Reviews，Genome Biology，Nucleic Acids Research，ISME Journal等高水平期刊上发表第一作者和通讯作者论文，总影响因子在450分以上。作为通讯作者参与6部英文书籍的撰写，并作为副主编参与编写了《硒：分子生物学与人体健康》一书。获2017年深圳市自然科学奖二等奖。目前担任中国生物物理学会生物微量元素分会理事、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员和多个国内外学会的会员。近5年负责主讲本科生课程《系统生物学与组学大数据》和研究生课程《系统生物学基础》。

主要研究方向：

1. 微量元素（如硒和金属）代谢、功能与进化规律的生物信息学研究，寻找元素代谢新基因和新调控机制；

2. 复杂疾病（如神经退行性疾病、糖尿病、肿瘤等）的系统生物学研究，基于组学大数据，开发新算法，揭示疾病发生发展的新分子机制，寻找新型生物标记物，建立智能化早期预警与监测平台。

实验室网站：https://metalbioinfolab.net/

  近期发表的论文

近5年发表的论文（*: 通讯作者）：


1.Zhang Y*, Huang B, Jin J, Xiao Y and Ying H. (2023) Recent advances in the application of ionomics in metabolic diseases. Front Nutr 9:1111933.（IF：6.590，中科院2区）

2.Zhang Y*, Jin J, Huang B, Ying H, He J, Jiang L. (2022) Selenium metabolism and selenoproteins in prokaryotes: a bioinformatics perspective. Biomolecules 12(7):917. （IF：6.064，中科院2区）

3.Zhang Y*, He J, Jin J, Ren C. (2022) Recent advances in the application of metallomics in diagnosis and prognosis of human cancer. Metallomics 14(7):mfac037. （IF：4.636，中科院2区）

4.He Z, Zheng L, Zhao X, Li X, Xue H, Zhao Q, Ren B, Li N, Ni J, Zhang Y*, Liu Q*. (2022) An Adequate Supply of Bis(ethylmaltolato)oxidovanadium(IV) Remarkably Reversed the Pathological Hallmarks of Alzheimer's Disease in Triple-Transgenic Middle-Aged Mice. Biol Trace Elem Res 200(7):3248-3264. （IF：4.081，中科院3区）

5.Xu Y, Cao J, Jiang L, Zhang Y*. (2021) Biogeographic and evolutionary patterns of trace element utilization in marine microbial world. Genomics Proteomics Bioinformatics 19:958-972.（IF：7.051，中科院1区）

6.Yao F, Yan C, Zhang Y, Shen L, Zhou D, Ni J. (2021) Identification of blood protein biomarkers for breast cancer staging by integrative transcriptome and proteome analyses. J Proteomics 230:103991. （IF：3.855，中科院2区）

7.Zhang Y*, Xu Y, Zheng L. (2020) Disease ionomics: understanding the role of ions in complex disease. Int J Mol Sci 21(22):8646. （IF：6.208，中科院2区）

8.Jiang L*, Lu Y, Zheng L, Li G, Chen L, Zhang M, Ni J, Liu Q, Zhang Y*. (2020) The algal selenoproteomes. BMC Genomics 21(1):699. （IF：3.969，中科院2区）

9.Zhang Y*, Zheng J. (2020) Bioinformatics of metalloproteins and metalloproteomes. Molecules 25(15):3366. （IF：4.412，中科院3区）

10.Chen D, Li G, Ji C, Lu Q, Qi Y, Tang C, Xiong J, Hu J, Yasar FBA, Zhang Y*, Hoon DSB, Yao Y*, Zhou L. (2020) Enhanced B7-H4 expression in gliomas with low PD-L1 expression identifies super-cold tumors. J ImmunoTher Cancer 8(1):e000154. （IF：12.469，中科院1区）

11.Shen Z, Lin J, Teng J, Zhuang Y, Zhang H, Wang C, Zhang Y*, Ding X*, Zhang X*. (2020) Association of Urinary Ionomic Profiles and Acute Kidney Injury and Mortality in Patients after Cardiac Surgery. J Thorac Cardiovasc Surg 159(3):918-926. （IF：5.261，中科院二区）

12.Ying H, Zhang Y*. (2019) Systems biology of selenium and complex disease. Biol Trace Elem Res 192(1):38-50. （IF：2.639，中科院3区）

13.Zhang Y*, Ying H, Xu Y. (2019) Comparative genomics and metagenomics of the metallomes. Metallomics 11(6):1026-1043. （IF：3.796，中科院2区，封面文章）

14.Li Q, Hu C, Lin J, Yang Z, Zhou Q, Yang R, Yuan H, Zhu X, Lv Y, Liang Q, Lv Z, Sun L, Zhang Y*. (2019) Urinary ionomic analysis reveals new relationship between minerals and longevity in a Han Chinese population. J Trace Elem Med Biol 53:69-75. （IF：3.245，中科院3区）

15.Lin J, Wu YJ, Liang X, Ji M, Ying HM, Wang XY, Sun X, Shao CH, Zhan LX, Zhang Y*. (2019) Network-based integration of mRNA and miRNA profiles reveals new target genes involved in pancreatic cancer. Mol Carcinog 58(2):206-218.（IF：3.825，中科院2区）

16.Yao F, Zhang K, Zhang Y, Guo Y, Li A, Xiao S, Liu Q, Shen L, Ni J. (2019) Identification of Blood Biomarkers for Alzheimer's Disease Through Computational Prediction and Experimental Validation. Front Neurol 9:1158.（IF：2.635，中科院3区）

17.Li F, Liu CF, Xu YZ, Guo YL, Xue SW, Kong XD, Zhang HB, Zhang Y, Kang JS. (2019) Neonatal lethality and recycling defect of transferrin receptor in mice with Syntaxin12/13 disruption. Protein Cell 10(1):67-71. （IF：10.164，中科院1区）

18.Lin S, Liu Y, Goldin LR, Lyu C, Kong X, Zhang Y, Caporaso NE, Xiang S, Gao Y. (2019) Sex-related DNA methylation differences in B cell chronic lymphocytic leukemia. Biol Sex Differ 10(1):2.（IF：3.188，中科院3区）

19.Peng T, Xu Y, Zhang Y*. (2018) Comparative genomics of molybdenum utilization in prokaryotes and eukaryotes. BMC Genomics 19(1):691. （IF：3.501，中科院2区）

20.Yao F, Hong X, Li S, Zhang Y, Zhao Q, Du W, Wang Y, Ni J. (2018) Urine-Based Biomarkers for Alzheimer's Disease Identified Through Coupling Computational and Experimental Methods. J Alzheimers Dis 65(2):421-431. （IF：3.517，中科院2区）

21.Xie Y, Liu Q, Zheng L, Wang B, Qu X, Ni J, Zhang Y, Du X. (2018) Se-Methylselenocysteine Ameliorates Neuropathology and Cognitive Deficits by Attenuating Oxidative Stress and Metal Dyshomeostasis in Alzheimer Model Mice. Mol Nutr Food Res 62(12):e1800107. （IF：4.653，中科院2区）

22.Zhang F, Hu Z, Li G, Huo S, Ma F, Cui A, Xue Y, Han Y, Gong Q, Gao J, Bian H, Meng Z, Wu H, Long G, Tan Y, Zhang Y, Lin X, Gao X, Xu A, Li Y. (2018) Hepatic CREBZF couples insulin to lipogenesis by inhibiting insig activity and contributes to hepatic steatosis in diet-induced insulin-resistant mice. Hepatology 68(4):1361-1375. （IF：14.971，中科院一区）

 

编写书籍：


1.Gladyshev VN, Zhang Y*. (2013) The Metallome, in Metals in Cells. Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry, John Wiley & Sons, Ltd, pp. 17-38.


2.Gladyshev VN, Zhang Y*. (2013) Comparative genomics analysis of the metallomes, in Metal Ions in Life Sciences 12, Metallomics and the Cell, Springer, pp. 529-580.


3.Zhang Y*. (2013) Several chapters in Encyclopedia of Systems Biology, Springer.


4.Zhang Y*. (2016) Prokaryotic selenoproteins and selenoproteomes, in Selenium - Its Molecular Biology and Role in Human Health, 4th Edition, Springer, pp. 141-150.


5.Gladyshev VN, Zhang Y*. (2016) Abundance, ubiquity, and evolution of molybdoenzymes, in Molybdenum and Tungsten Enzymes: Biochemistry, The Royal Society of Chemistry, pp. 81-99.


6.Zhang Y*. (2017) Trace elements and healthcare: a bioinformatics perspective, in Translational Informatics in Smart Healthcare, Springer, pp. 63-98.


7.硒：分子生物学与人体健康. (2018) 主编：雷新根，王福俤，副主编：刘琼，闵军霞，张焱等，科学出版社。


8.张焱*，叶小丽，乐颖影. （2020）食品安全风险评估中的暴露生物标志物，《生物标志物与食品安全风险评估》，化学工业出版社，生物.医药出版分社，pp.101-132.

 

职称 特聘教授 职位
所属系 生物科学系 办公室 丽湖校区守慧楼306
办公电话 0755-26922024 邮箱 zhangyan@szu.edu.cn
工作职责 教学、科研 个人简介 <p>张焱，男，1974年5月生，博士生导师，深圳大学生命与海洋科学学院特聘教授，深圳大学脑病与大数据研究所所长，深圳大学神经系统疾病临床医学研究中心副主任。1997年毕业于浙江大学医学院临床医学系，获学士学位; 2002年于中国医学科学院&北京协和医学院基础所生物医学工程系获博士学位。2002年至2009年在美国内布拉斯加大学林肯分校任博士后和高级研究助理。2009年至2011年在美国哈佛医学院&布莱根妇女医院医学系担任讲师和副遗传学家。2011年至2016年任中科院上海生命科学研究院研究员，2012年入选中科院“百人计划”。2015年获深圳市“鹏城学者”特聘教授。2017年入职深圳大学生命与海洋科学学院。先后主持国家自然科学基金、中科院、省市级科研项目和横向项目10多项。已在国外学术刊物上发表论文近90篇，包括在Chemical Reviews，Genome Biology，Nucleic Acids Research，ISME Journal等高水平期刊上发表第一作者和通讯作者论文，总影响因子在450分以上。作为通讯作者参与6部英文书籍的撰写，并作为副主编参与编写了《硒：分子生物学与人体健康》一书。获2017年深圳市自然科学奖二等奖。目前担任中国生物物理学会生物微量元素分会理事、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员和多个国内外学会的会员。近5年负责主讲本科生课程《系统生物学与组学大数据》和研究生课程《系统生物学基础》。</p><p>主要研究方向：</p><p style="text-indent: 2em;">1. 微量元素（如硒和金属）代谢、功能与进化规律的生物信息学研究，寻找元素代谢新基因和新调控机制；</p>
<p>2. 复杂疾病（如神经退行性疾病、糖尿病、肿瘤等）的系统生物学研究，基于组学大数据，开发新算法，揭示疾病发生发展的新分子机制，寻找新型生物标记物，建立智能化早期预警与监测平台。</p>
<p>实验室网站：https://metalbioinfolab.net/</p>