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教授

 

  基本信息
  • 姓      名：张焱
  • 职      称：特聘教授
  • 职      位：
  • 所  属 系：生物科学系
  • 办公地点：丽湖校区守慧楼306
  • 办公电话：0755-26922024
  • 邮      箱：zhangyan@szu.edu.cn
  • 工作职责：教学、科研
  个人简介

张焱，男，1974年5月生，博士生导师，深圳大学生命与海洋科学学院特聘教授，深圳大学脑病与大数据研究所所长，深圳大学神经系统疾病临床医学研究中心副主任。1997年毕业于浙江大学医学院临床医学系，获学士学位；2002年于中国医学科学院&北京协和医学院生物医学工程系获博士学位。2002年至2009年在美国内布拉斯加大学林肯分校任博士后和高级研究助理。2009年至2011年在美国哈佛医学院&布莱根妇女医院医学系担任讲师和副遗传学家。2011年至2016年任中科院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室和营养科学研究所研究员，2012年入选中科院“百人计划”。2015年获深圳市“鹏城学者”特聘教授。2017年入职深圳大学生命与海洋科学学院。先后主持国家自然科学基金、中科院、省市级等科研项目20余项。已发表SCI论文90多篇，包括在Chemical Reviews，Genome Biology，Nucleic Acids Research，ISME Journal，Genomics, Proteomics & Bioinformatics等高水平期刊上发表第一作者和通讯作者论文，总影响因子在480分以上。2021年至2024年每年均入选“全球前2%顶尖科学家榜单”。作为通讯作者参与6部英文书籍的撰写，并作为副主编参与编写了《硒：分子生物学与人体健康》一书。获2017年深圳市自然科学奖二等奖。目前担任中国生物物理学会生物微量元素分会理事、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员、中国生物信息学会网络生物学专委会委员和多个国内外学会的会员。近5年负责主讲本科生课程《系统生物学与组学大数据》和研究生课程《系统生物学基础》。

主要研究方向： 1. 微量营养素（如硒、金属和维生素）代谢与功能网络及其进化规律的生物信息学研究，寻找相关新基因和新调控机制； 2. 复杂疾病（如神经退行性疾病、糖尿病、肿瘤等）的系统生物学研究，基于各种组学大数据，开发新算法，揭示疾病发生发展的新分子机制，寻找新型生物标记物，建立智能化早期预警与监测平台。

实验室网站：https://metalbioinfolab.net/

  近期发表的论文

近5年发表的论文（*:通讯作者）：

  1. Xiao Y,Zhang Y*. (2025) deep-Sep: a deep learning-based method for fast and accurate prediction of selenoprotein genes in bacteria.mSystems10:e0125824.（IF：5，中科院2区Top）

  2. Zhang Y*, Zhang Z, Li H, Xiao Y, Ying H. (2025) Recent advancements in the application of multi-elemental profiling and ionomics in cardiovascular diseases.J Trace Elem Med Biol88:127616.（IF：3.6，中科院3区）

  3. Huang B, Xiao Y,Zhang Y*. (2024) Asgard archaeal selenoproteome reveals a roadmap for the archaea-to-eukaryote transition of selenocysteine incorporation machinery.ISME J18(1):wrae111.（IF：11.0，中科院1区Top，自然指数期刊）

  4. Zhang Y*, Huang B, Jin J, Xiao Y, Ying H. (2023) Recent advances in the application of ionomics in metabolic diseases.Front Nutr9:1111933.（IF：6.590，中科院2区）

  5. Zhang Y*, Jin J, Huang B, Ying H, He J, Jiang L. (2022) Selenium metabolism and selenoproteins in prokaryotes: a bioinformatics perspective.Biomolecules12(7):917.（IF：6.064，中科院2区）

  6. Zhang Y*, He J, Jin J, Ren C. (2022) Recent advances in the application of metallomics in diagnosis and prognosis of human cancer.Metallomics14(7):mfac037.（IF：4.636，中科院2区）

  7. He Z, Zheng L, Zhao X, Li X, Xue H, Zhao Q, Ren B, Li N, Ni J,Zhang Y*, Liu Q*. (2022) An Adequate Supply of Bis(ethylmaltolato)oxidovanadium(IV) Remarkably Reversed the Pathological Hallmarks of Alzheimer's Disease in Triple-Transgenic Middle-Aged Mice.Biol Trace Elem Res200(7):3248-3264.（IF：4.081，中科院3区）

  8. Xu Y, Cao J, Jiang L,Zhang Y*. (2021) Biogeographic and evolutionary patterns of trace element utilization in marine microbial world.Genomics Proteomics Bioinformatics19:958-972.（IF：11.5，中科院1区Top）

  9. Yao F, Yan C,Zhang Y, Shen L, Zhou D, Ni J. (2021) Identification of blood protein biomarkers for breast cancer staging by integrative transcriptome and proteome analyses.J Proteomics230:103991.（IF：3.855，中科院2区）

  10. Zhang Y*, Xu Y, Zheng L. (2020) Disease ionomics: understanding the role of ions in complex disease.Int J Mol Sci21(22):8646.（IF：6.208，中科院2区）

  11. Jiang L*, Lu Y, Zheng L, Li G, Chen L, Zhang M, Ni J, Liu Q,Zhang Y*. (2020) The algal selenoproteomes.BMC Genomics21(1):699.（IF：3.969，中科院2区Top）

  12. Zhang Y*, Zheng J. (2020) Bioinformatics of metalloproteins and metalloproteomes.Molecules25(15):3366.（IF：4.412，中科院2区）

  13. Chen D, Li G, Ji C, Lu Q, Qi Y, Tang C, Xiong J, Hu J, Yasar FBA,Zhang Y*, Hoon DSB, Yao Y*, Zhou L. (2020) Enhanced B7-H4 expression in gliomas with low PD-L1 expression identifies super-cold tumors.J ImmunoTher Cancer8(1):e000154.（IF：12.469，中科院1区Top）

  14. Shen Z, Lin J, Teng J, Zhuang Y, Zhang H, Wang C,Zhang Y*, Ding X*, Zhang X*. (2020) Association of Urinary Ionomic Profiles and Acute Kidney Injury and Mortality in Patients after Cardiac Surgery.J Thorac Cardiovasc Surg159(3):918-926.（IF：5.261，中科院1区Top）

编写书籍

  1. Gladyshev VN,Zhang Y*. (2013) The Metallome, inMetals in Cells. Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry, John Wiley & Sons, Ltd, pp. 17-38.

  2. Gladyshev VN,Zhang Y*. (2013) Comparative genomics analysis of the metallomes, inMetal Ions in Life Sciences 12, Metallomics and the Cell,Springer, pp. 529-580.

  3. Zhang Y*. (2013) Several chapters inEncyclopedia of Systems Biology, Springer.

  4. Zhang Y*. (2016) Prokaryotic selenoproteins and selenoproteomes, inSelenium - Its Molecular Biology and Role in Human Health, 4th Edition, Springer, pp. 141-150.

  5. Gladyshev VN,Zhang Y*. (2016) Abundance, ubiquity, and evolution of molybdoenzymes, inMolybdenum and Tungsten Enzymes: Biochemistry, The Royal Society of Chemistry, pp. 81-99.

  6. Zhang Y*. (2017) Trace elements and healthcare: a bioinformatics perspective, inTranslational Informatics in Smart Healthcare, Springer, pp. 63-98.

  7. 硒：分子生物学与人体健康. (2018)主编：雷新根，王福俤，副主编：刘琼，闵军霞，张焱等，科学出版社。

  8. 张焱*，叶小丽，乐颖影.（2020）食品安全风险评估中的暴露生物标志物，《生物标志物与食品安全风险评估》，化学工业出版社，生物.医药出版分社，pp.101-132.

职称 特聘教授 职位
所属系 生物科学系 办公室 丽湖校区守慧楼306
办公电话 0755-26922024 邮箱 zhangyan@szu.edu.cn
工作职责 教学、科研 个人简介 <p>张焱，男，1974年5月生，博士生导师，深圳大学生命与海洋科学学院特聘教授，深圳大学脑病与大数据研究所所长，深圳大学神经系统疾病临床医学研究中心副主任。1997年毕业于浙江大学医学院临床医学系，获学士学位；2002年于中国医学科学院&北京协和医学院生物医学工程系获博士学位。2002年至2009年在美国内布拉斯加大学林肯分校任博士后和高级研究助理。2009年至2011年在美国哈佛医学院&布莱根妇女医院医学系担任讲师和副遗传学家。2011年至2016年任中科院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室和营养科学研究所研究员，2012年入选中科院“百人计划”。2015年获深圳市“鹏城学者”特聘教授。2017年入职深圳大学生命与海洋科学学院。先后主持国家自然科学基金、中科院、省市级等科研项目20余项。已发表SCI论文90多篇，包括在Chemical Reviews，Genome Biology，Nucleic Acids Research，ISME Journal，Genomics, Proteomics & Bioinformatics等高水平期刊上发表第一作者和通讯作者论文，总影响因子在480分以上。2021年至2024年每年均入选“全球前2%顶尖科学家榜单”。作为通讯作者参与6部英文书籍的撰写，并作为副主编参与编写了《硒：分子生物学与人体健康》一书。获2017年深圳市自然科学奖二等奖。目前担任中国生物物理学会生物微量元素分会理事、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员、中国生物信息学会网络生物学专委会委员和多个国内外学会的会员。近5年负责主讲本科生课程《系统生物学与组学大数据》和研究生课程《系统生物学基础》。

<p>主要研究方向：
1. 微量营养素（如硒、金属和维生素）代谢与功能网络及其进化规律的生物信息学研究，寻找相关新基因和新调控机制；
2. 复杂疾病（如神经退行性疾病、糖尿病、肿瘤等）的系统生物学研究，基于各种组学大数据，开发新算法，揭示疾病发生发展的新分子机制，寻找新型生物标记物，建立智能化早期预警与监测平台。

<p>实验室网站：https://metalbioinfolab.net/